In un tempo remoto, in un mondo tecnologicamente avanzato, una leggenda sta per essere rievocata... Il mondo di Spira mille anni prima del gioco è stato sconvolto da una catastrofe naturale che distrusse tutto e tutti. Questo spirito distruttivo non è un'entità malvagia, ma più semplicemente una calamita naturale imprevedibile. Da tutti è conosciuto con il nome di Sin. I credenti della religione Yevon pensano che questo spirito sia una maledizione che si è verificata per punire gli umani poiché si affidavano ciecamente alla tecnologia. Ora gli abitanti di Spira vivono senza ricorrere all'uso di macchinari, sfruttando unicamente le risorse che la nature offre.

La tribù di Albhed però è contraria a questi  insegnamenti e continua a sopravvivere grazie all'uso delle macchine. I capi di Yevon hanno istituito una nuova casta di umani in grado di distruggere lo spirito Sin temporaneamente, questi sono i Summoner (Invocatori), dei combattenti magici capaci di invocare magiche e potentissime creature, gli Eoni. Uno di questi è Braska detto il Grande Summoner, che è passato alla storia per aver distrutto Sin dieci anni prima del gioco. Adesso è il turno di Yuna, la figlia di Braska che dovrà salvare il mondo un'alta volta... Yuna prima di poter affrontare corpo a corpo il cataclisma naturale deve prima incamminarsi in un viaggio di preparazione dove dovrà acquisire nuovi e sempre più potenti Eoni, fino all'acquisizione dell'"Invocazione Suprema" spirito dotato di enormi poteri magici che può distruggere Sin.

Durante questo viaggio, Yuna sarà protetta dalle sue guardie del corpo o più semplicemente dai suoi amici. A far parte di questa avventura ci sarà il campione di Blitzball Tidus, la sua guardia ufficiale Kimahri, il misterioso Auron, la bella Lulu, il robusto Wakka, l'immatura Rikku. La comagnia cercherà di agire durante il "Nagi Setsu (Bonacciale)" ovvero il periodo che va dalla distruzione del Sin fino alla sua successiva resurrezione, fino a generare un ciclo infinito costituito da una fase di tranquillità e da una dove c'e' orrore e devastazione. 

Riusciranno, i nostri eroi, a percorrere senza intoppi le tappe del loro pellegrinaggio fino al raggiungimento dell'Invocazione Suprema (l'unica in grado di distruggere Sin)?? Un viaggio tra fantasia e realtà, un viaggio tra libertà e costrizione, un viaggio in Final Fantasy X.